A reestruturação administrativa, regulamentada pela Resolução 36 CJF3R, em dezembro de 2018, foi proposta pelo Juiz Federal Diretor do Foro, Ricardo Damasceno de Almeida, após diversas pesquisas junto a outras Seções Judiciárias no intuito de otimizar os processos de trabalho e melhorar a organização dos serviços da área administrativa.
Entre as alterações promovidas pela reestruturação, está a criação da Seção de Saúde e Bem-Estar Social, que terá a finalidade de coordenar o planejamento e a execução do sistema de serviços de assistência à saúde e qualidade de vida, promovendo atividades relativas à promoção da saúde, ao bem-estar biopsicossocial e à prevenção de doenças de magistrados e servidores da SJMS.
Foi criada também a Seção de Comunicação Social, que terá, dentre outras, as atribuições de prestar assessoria à Diretoria do Foro, aos magistrados e aos gestores da Seção Judiciária de MS nas questões relativas à comunicação social e ao relacionamento com a imprensa, redigir e publicar notícias de interesse público no site da JFMS, produzir releases, notas, comunicados e reportagens destinados aos veículos de comunicação para informar ou para prestar esclarecimentos sobre processos em andamento ou julgados na JFMS.
Outro grande avanço da reestruturação foi a implantação da Seção de Modernização Administrativa, que tem a finalidade de realizar levantamento das necessidades, objetivos, prioridades e estrutura organizacional dos setores requisitantes de alterações administrativas, prestar consultoria aos gestores na implementação de projetos e na gestão de melhorias e mudanças nos processos de trabalho, com foco em resultados, estudar e propor medidas visando à eficiência e otimização de recursos materiais, físicos e humanos.
A reestruturação só foi possível devido a alguns ajustes, como a extinção de alguns setores e cargos, uma vez que a mudança não implicou em aumento no gasto com a Folha de Pagamento.